La Giunta adotta gli atti obbligatori di governo previsti nel Piano Sanitario Regionale: il Piano Integrato di Salute;  i progetti integrati per obiettivi di salute;  il bilancio preventivo annuale e pluriennale, ecc.

Competono alla Giunta: la nomina del Presidente e del Direttore Tecnico e del Segretario della SDS; la nomina dei membri del Comitato di partecipazione;
 la nomina del Collegio dei Revisori di Conti; l'attribuzione e la definizione degli incarichi dirigenziali e quelli di collaborazione esterna, ecc.

La Giunta ha altre competenze, come organo collegiale che esprime la volontà della SDS.